棉花枯萎病菌的菌落因菌系、生理小种及培养基不同而有较大的差异,并无固定的形态,棉花枯萎病的病菌为尖孢镰刀菌,菌丝透明,具分隔,在侧生的孢子梗上生出分生孢子。该病菌的生理小种国外报道有6个,中国除第3号小种外新定7号、8号二个新小种,其中7号小种在中国分布广,致病强。
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